Berdasarkan Kalender Pendidikan Tahun Ajaran 2025/2026, hari pertama masuk sekolah dimulai pada hari Senin, 14 Juli 2025. Agenda SMPN 2 Sumenep di hari pertama tersebut diantaranya: 1) upacara bendera rutin setiap hari Senin sekaligus pembukaan MPLS (Masa Pengenalan Lingkungan Sekolah) bagi murid baru; 2) rapat dinas guru dan tenaga kependidikan dengan acara pokok pembagian tugas mengajar dan tugas tambahan bagi guru; 3) konsolidasi kelas oleh masing-masing wali kelas.
Pada pembukaan MPLS oleh Kepala SMPN 2 Sumenep (Nanik Mujiati, S.Pd.), setelah pengarahan singkat dilanjutkan dengan pengalungan secara simbolis tanda peserta MPLS kepada wakil murid baru dan diikuti oleh seluruh murid baru tahun ajaran 2025/2026. Murid baru SMPN 2 Sumenep tahun ajaran 2025/2026 sejumlah 290 orang, dalam kegiatan MPLS ini dibagi menjadi 10 gugus, dimana masing-masing gugus dibina oleh 1 (satu) orang guru pembina dan dibantu oleh pengurus OSIS SMPN 2 Sumenep.